常氏和朱雄英相继去世后，朱允炆对朱棣更加厌恶。朱棣北征大胜，翰林院讨论朱棣的功劳时，朱允炆深觉得朱棣就是大明的祸害，一个臣子竟然敢如此桀骜不驯。
朱棣不同于朱允炆，他经过战场，立志杀敌，而朱允炆在母亲的管教下不怎么重武，即使后来学武了，也是比不上朱棣的。在吕氏的眼里，朱棣不认可他的儿子，而是偏爱朱雄英，甚至当着她的面说让朱允炆将来好好辅佐朱雄英。吕氏自然心有不甘，这也是未来朱允炆称帝，吕氏煽风点火，说朱棣坏话的原因。朱允炆从小就受到母亲教导，母亲的话他自然会听。
当朱棣当值得锦衣卫时，他和朱标因观点不同发生了争执，恰好被朱允炆听到。朱允炆便觉得朱棣不尊重兄长。综上所述，朱棣对朱允炆的王位构成了威胁，两人之间的矛盾只会越来越激烈。这就是朱允炆削藩的原因。
锦衣卫是朱元璋提出的，而朱棣就是朱元璋手中最锋利的刀，他用迅雷手段处理了一大批人，宁愿错杀也不愿放过一个人，这使锦衣卫处于风口浪尖，触碰了胡惟庸党的利益。双方闹得是满城风雨，最终以朱棣被贬为庶人结尾。
胡惟庸案是锦衣卫功劳簿上的一个里程碑，尘埃落定后，反对的声音又再次出现。朱棣第二次辞退锦衣卫的职责是因为局势稳定，胡逆案中又涉及了太多无辜之人。但不久后，朱元璋突然又召回朱棣，也让李善长党大惊失色，此次回来就是为了解决李善长的。朱棣在当值锦衣卫的时间里，积下了太多威望，朱允炆害怕情由所原。
掌权者都不希望身边有一个功高盖主的人，作为守业皇帝，朱允炆必定回对藩王下手，专制是历代皇帝的首要任务，但朱允炆太心急了，手段太激进了，激起了朱棣的逆反心理，最终，朱允炆以失败告终。
