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首当其冲的是各地煤炭价格的较大差异导致原料成本差异巨大。比如河南、鲁南等地某些煤炭资源相对缺少的地方，煤制甲醇的原料需要外采，此时运费再加上原料价格可能高达数百甚至上千元。但是陕西、内蒙等地的煤炭资源丰富，有些甲醇工厂的原料甚至是隔壁煤炭企业直接用传送带送入加工流程的，连运费都能每吨节省200元，更别提实际成本就是坑口价之上的折扣价了。按照2015年我们西北调研的情况，当时西北多数地方单吨成本不足1000元，还包含了部分折旧或管理费用，而对应当时当地的价格在1600元左右。这样的话成本支撑其实不是很明显。而且，由于每家工厂使用的原料煤和燃料煤品种差异巨大，导致成本核算也是千差万别，很难计算出一个明确的 成本支撑位置。
其次是原料价格波动与物流成本变化导致不同地区的价格差距较大，导致支撑位很难有效计算。
最后，煤制甲醇的长期良好利润导致鲜有价格打到多数煤制甲醇企业成本线附近的时候，所以也较难观测到支撑作用的生效。